El rey del Meikai, Yakumo, ordena el diluvio del Mundo Espiritual y planea apoderarse del mundo humano, pero necesita el poder de una gema diabólica que fue guardada en el mundo espiritual; dicha gema fue resguardada por Botan luego de la desaparición aparente del mismo y regresa a la ciudad residente de Yusuke para informarle lo ocurrido.
Un nuevo personaje femenino que aparece, Hinageshi, una aprendiz a responsabilidad de Botan, propone a los héroes el plan de activar cinco torres de energía para salvar el mundo espiritual, así que ella y el cuarteto protagónico (Yusuke, Kurama, Hiei y Kuwabara) van tras los puntos importantes de la ciudad.
Pero ocurre poco tiempo antes que tres de los vasallos de Yakumo persigan a los detectives e intenten destruir los puntos donde emergen las torres. Si esto último ocurre, la energía latente dentro será utilizada para desaparecer definitivamente el mundo espiritual. Es una misión de vida o muerte en la que Yusuke y compañía deberán enfrentar a Yakumo y sus vasallos.